1988–2015: Arvoa innovaatiosta
Vuodesta 1988 vuoteen 2015 Boehringer Ingelheim toi markkinoille lukuisia tärkeitä ja innovatiivisia tuotteita.
Kun Hubertus Liebrecht kuoli vuonna 1991, omistajaperhe teki perustavanlaatuisia päätöksiä yhtiön suuntaviivoista. Päätökset perustuivat terveydenhoidon standardeissa tapahtuneisiin kansainvälisiin muutoksiin ja terveydenhoitokustannusten kasvuun. Tavoitteena oli säilyttää yhtiön johtoasema markkinoilla.
Albert Boehringer Juniorin vävy Erich von Baumbach nimitettiin osakaskomitean puheenjohtajaksi 1.1.1992. Samalla kertaa Heribert Johann nimitettiin johtokunnan edustajaksi. Tämä merkitsi, että ensimmäisen kerran yhtiön historiassa liiketoiminnan johtopaikoilla ei ollut ainuttakaan omistajasuvun jäsentä.
Vuonna 1994 yhtiön osakkaat ja Boehringer Ingelheimin johto esittelivät visionsa “Arvoa innovaatiosta”, joka antoi suuntaviivat koko konsernin tulevaisuudelle. “Visio ja johtajuus” ovat ohjaavia periaatteita, joiden varassa Boehringer Ingelheimin visiota toteutetaan. Vuoden kuluttua järjestettiin ensimmäinen Arvoa innovaatiosta -teemapäivä kaikissa yhtiön toimipisteissä maailmanlaajuisesti. Yhtiön tavoite ankkuroituu sen toiminta-ajatukseen ja innovaatioiden lähtökohtaan, joka on ihmisten auttaminen.
Vuonna 2007 Christian Boehringer nimitettiin osakaskomitean puheenjohtajaksi. Nimityksen seurauksena tämän korkeimman päätöksentekoelimen johdossa on 16 vuoden tauon jälkeen taas yhtiön perustajan jälkeläinen.
Vuonna 2009 Hubertus von Baumbach liittyi yhtiön johtokuntaan ja sai vastuulleen talous- ja eläinterveysosastot. Tämä tarkoittaa, että ensimmäisen kerran sen jälkeen, kun Hubertus Liebrecht kuoli vuonna 1991, omistajasuvun jäsen, joka istuu yhtiön johtokunnassa, on vastuussa Boehringer Ingelheimin operationaalisesta liiketoiminnasta.
Vuonna 2010 juhlittiin Boehringer Ingelheimin 125. vuosipäivää.